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第６区 区間記録
第 6 区 （10.2km：島根ワイナリー前⇒出雲ドーム前）区間記録：メクボ・ジョブ・モグス（山梨学院）28:33（2006・第18回大会）
| 順位 | № | 氏名 | チーム名 | タイム |
| 1 | 2 | ギタウ ダニエル | 日本大学 | 28分28秒（区間新） |
| 2 | 9 | Ondiba Cosmas | 山梨学院大学 | 29分22秒 |
| 3 | 19 | KIRAGU NJUGUNA | 第一工業大学 | 29分33秒 |
| 4 | 1 | 佐藤 悠基 | 東海大学 | 29分49秒 |
| 5 | 5 | 宇賀地 強 | 駒澤大学 | 30分11秒 |
| 6 | 10 | 平川 信彦 | 中央大学 | 30分28秒 |
| 7 | 15 | 藤原 庸平 | 立命館大学 | 30分36秒 |
| 8 | 6 | 尾崎 貴宏 | 早稲田大学 | 30分44秒 |
| 9 | 11 | 中村 亮太 | 帝京大学 | 30分54秒 |
| 10 | 12 | 森 雅也 | 東洋大学 | 31分05秒 |
| 11 | 8 | 山中 宣幸 | 亜細亜大学 | 31分12秒 |
| 12 | 7 | 渡部 政彦 | 中央学院大学 | 31分29秒 |
| 13 | 14 | 中山 祐平 | 愛知工業大学 | 31分54秒 |
| 14 | 16 | 林 哲也 | 京都産業大学 | 31分57秒 |
| 15 | 22 | 吉田 明広 | 大東文化大学 | 32分01秒 |
| 16 | 21 | Mark Olivier | 米国IVYリーグ選抜 | 32分29秒 |
| 17 | 3 | 阪部 友洋 | 北海道学連選抜 | 32分33秒 |
| 18 | 20 | 五島 孝紀 | 日本文理大学 | 32分36秒 |
| 19 | 13 | 羽庭 努 | 北信越学連選抜 | 33分02秒 |
| 20 | 17 | 佐藤 雄介 | 広島経済大学 | 33分43秒 |
| 20 | 18 | 山下 淳一 | 中国四国学連選抜 | 33分43秒 |
| 22 | 4 | 大場 直樹 | 東北学連選抜 | 34分16秒 |